Hauptziele der Gewebebank Berlin-Brandenburg (GBB) sind die Aufrechterhaltung von Transparenz bei der Gewebespende und Gewebebearbeitung, die Verbesserung der Spendergewinnung sowie die Zusammenarbeit auf allen Gebieten des Gewebegesetzes (u.a. Koordination der Gewebespende, Dokumentation der Gewebespende und Gewebebearbeitung, Testung der Gewebetransplanatate). Das regionale Netzwerk umfasst dabei die Gewebebanken, die Gewebespende-Koordination, die Spendekrankenhäuser, die Deutsche Stiftung Organtransplantation - Region Nord-Ost, die anwendenden Kliniken, die Landesbehörden und den Fachbeirat.

Zwischen dem Krankenhaus und der Gewebebank Berlin-Brandenburg wird eine Kooperation zur Gewinnung von Gewebespendern vertraglich vereinbart. Dies soll der verbesserten Versorgung von Patienten in Berlin und Brandenburg mit hochwertigen Gewebetransplantaten dienen. Die Gewinnung von Gewebespendern in den Krankenhäusern erfolgt aktiv durch die Gewebebank Berlin-Brandenburg. Der vertraglich festzulegende personelle und zeitliche Aufwand des Krankenhauses wird vergütet. Derzeit bestehen mit den in der Grafik aufgeführten Kliniken in Berlin und Brandenburg behördlich geprüfte Kooperationsvereinbarungen gemäß Arzneimittelgesetz (§ 20b) und Arzneimittelwirkstoffverordnung (§ 34).